伊犁職業(yè)技術(shù)學(xué)院經(jīng)新疆維吾爾自治區(qū)、伊犁哈薩克自治州人民政府批準(zhǔn)，于2002年3月11日由原新疆伊犁畜牧獸醫(yī)學(xué)校、伊犁農(nóng)業(yè)學(xué)校、伊犁農(nóng)牧機(jī)械化學(xué)校三所中等專業(yè)學(xué)校合并成立，是一所以農(nóng)科為主，以畜牧獸醫(yī)為特色，文理兼?zhèn)涞膰?guó)家公辦的普通高等職業(yè)院校。2017年8月，學(xué)院入選為教育部第二批現(xiàn)代學(xué)徒制試點(diǎn)單位。

原新疆伊犁畜牧獸醫(yī)學(xué)校成立于1956年、伊犁農(nóng)業(yè)學(xué)校成立于1955年、伊犁農(nóng)牧機(jī)械化學(xué)校創(chuàng)立于1965年，三校均是自治區(qū)創(chuàng)建較早的重點(diǎn)中等專業(yè)學(xué)校，建校至今已向社會(huì)輸送各類畢業(yè)生近30000人。